关于劳动法和劳动仲裁

情况是这样，今年3月我从原先的单位离职，离职之前的2月份我只上了8天班，原因是病假和事假，员工手册上规定了请一天的病假要扣一天的工资，请一天事假要扣2天的工资，因为我的工资只有1000元左右，所以人事算了扣款情况后，到今天跟我说我2月的`工资全扣了之后，公司还要扣700多块钱，就是说我现在欠了他们700多块钱。
问题是，我1月份是正常上班的，工资有800多块钱（做业务，工资不稳定），直到我3月离职到现在也没发，一直就找借口拖来拖去的，现在找到了这个理由，我欠公司700，公司欠我800，来回就变成我先交公司700，他们在给我800。
想请问熟悉法律或者劳动纠纷的朋友，企业有权凭员工请假的理由扣款直到整月工资扣没了还能再从当月扣吗？（当月变为负工资）
我要是申请劳动仲裁或者去法院胜算大吗？